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    高通量测序技术与应用圆满结束

    2018 LSAC生命科技论坛:高通量测序技术与应用圆满结束

      

    生物谷与慕尼黑展览(上海)有限公司共同主办的2018 LSAC生命科技论坛:高通量测序技术与应用”于 2018111日 在 2018 Analytica china同期展会期间召开!来自国内外有高校科研院所的师生、医院医务人员,企事业单位代表等,汇聚一堂,共同探讨了最新高通量测序的应用与发展。会议以专家演讲结合现场交流的方式进行,在短短为期一天会议中,众位专家分别就领域内热点研究问题做了演讲,参会代表踊跃提问,现场气氛十分活跃。(高通量测序技术)

     

    图一:2018 Analytica china 现场

     

    图二:会议现场

    上午半天,有三位讲者进行报告分别是,来自上海伯豪生物王德韬博士,就高通量测序组学技术与表观遗传分析方向,结合当前研究热点趋势与伯豪生物应用案例进行报告;建库技术是,高通量测序环节中最重要的环节之一,NEB公司杨毅博士就如何实现高效建库,不同样本及研究需求进行分享及讨论;来自纳奥生物的亓立峰博士报告内容是“CTC液体活检与伴随诊断一体化临床应用进展,并结合公司自主研发的第三代CTC活细胞捕获产品及临床应用案例进行分享。

     

    图三:从左到右分别“伯豪生物王德韬,NEB公司杨毅,纳奥生物亓立峰”

     

    图四:从左到右分别“格诺生物成璐,安捷伦全球产品经理Rainer Nitsche,上海其明信息李奇”

    下午第一位报告者是来自格诺生物首席医学官成璐博士,她报告题目是“基于CTC的单细胞测序数据分享及应用展望”, 报告概要如下:“与人类疾病研究从基因组到转录组、蛋白组再到表观组学的轨迹类似,单细胞研究也从早期的基因组和转录组测序快速向表观基因组研究推进,发展了scChIP-seqscATAC-seqscHi-C等一系列单细胞表观研究技术和scCOOL-seq等单细胞多组学技术。肿瘤循环细胞CTC是液体活检的重要类型,相对于ctDNACTC具有完整的细胞结构和相应的各项细胞特征。天然的单细胞存在形式使其成为单细胞测序研究的良好材料。基于高通量测序和单细胞组学的快速发展,CTC在肿瘤发生发展、肿瘤进化、肿瘤转移调控机制等基础及临床研究方面的应用前景更为广阔,但CTC鉴定及分离捕获的标准及技术瓶颈仍有待突破。”成博士同时结合格诺生物基于已有的CTC高效无损分离技术建立的高通量单细胞转录组测序平台及前期数据进行分享,相关工作得到大家一致好评。

    来自安捷伦生物分子分析事业部市场部全球产品经理,Rainer Nitsche,报告题目是“二代测序样本质控新发展——从FFPE DNAcfDNA”,并带来了安捷伦科技全球首发的相关产品最新特点及应用。报告摘要如下:“在过去的数年间,二代测序(NGS)在几乎所有的遗传研究和诊断领域发展成为了一个强大的工具。而任何NGS实验成功的关键是初始RNADNA样本以及它们所生成的文库的质量控制(QC)。大多数的文库制备工作仍然非常冗长,可谓是昂贵的步骤。为了避免“垃圾进垃圾出”的情况,需要严格的质控步骤。理想的NGS质控步骤应该是易于操作、经济 ,并且对于非常低浓度的样品也能够提供快速且无争议的结果。 确保样品“满足目标用途”的一种方法是应用自动化的电泳分离,并进行荧光检测和自动数据分析。该报告包括了NGS样本质控的最新发展,并给出实际应用案例。

    从血液样本(“液态活检”)或其他体液中提取的无细胞DNAcfDNA)在癌症研究和产前检测中变得越来越重要。准确地定量cfDNA样品对于确定测序前cDNA文库制备时合适的DNA用量是必不可少的。基于不同的样品处理或提取方法,cfDNA样品中可能含有较大的DNA片段,例如基因组DNA污染。高分子量的物质会对文库的制备产生负面影响,从而导致测序深度较低。报告中将展示不同cfDNA样品的案例并讨论其数据。

    上海其明信息CEO 李奇,报告内容为“中国基因数据与决策网络”,他在报告中带来在9月底结束的中国临床肿瘤大会(csco)上,其明公司对基因测序在肿瘤诊疗中的地位和困境做了一份调查。调查意在发现高通量测序对肿瘤诊疗发挥作用的期望和障碍。调查面涉及到110家肿瘤诊断产品公司和医疗服务机构。发现肿瘤诊断对高通量测序的期望在不断增大,但是高通量测序的价值却严重受限于其数据规模。从基因及其变异视角来看,每个个体都是特殊事件,千万种特殊汇总成为总体的普遍特征,从而使人群可以按基因特征归类和预测。若想实现基于基因数据的健康评估、诊断、预后预测,只有在汇集大量完全个体化离散的基因数据后才能实现。此外,仅有基因数据还无法对肿瘤诊疗进行决策。基因数据本身并不产生价值。基因数据还必须与深厚广泛的医学知识融合,才能具有决策能力。所以发现基因变化、存储基因变化、理解基因变化、应用变化的信息指导诊疗决策。这样才是完整的整体机制。结合相关问题,李奇总经理介绍了基因云计算系统GCBI(Gene Cloud of Biotechnology Information)产品及解决方案。

     

    生物谷作为专业的服务机构,秉承专业、专注、独立的精神,以会议实际效果为根本出发点,客观、公正地推动新技术的学术研究交流与开放合作,尤其是科研与临床结合,以及学术与产业转化,在专家与业内均赢得广泛口碑与赞誉。LSAC生命科技论坛作为品牌系列论坛之一已经举办多届。


            (本文来源生物谷)

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